u盘格式化的问题！

请问大侠，在对u盘进行格式化时，主机主要是用read和write命令来格式化u盘，那么我想问一下，在u盘格式化时，要不要对MBR（主引导记录），DBR（系统引导记录）做改动？那么文件分配表呢，要不要改动？

我的格式化中，用bushound看到的，基本上全部重新写，从块0开始，mbr,dbr,fat全部重写。