PCI设备的速度测试之疑问？有精确至毫秒级甚至是100微秒级的函数吗？

我有个PCI设备，是用作数据处理的。我在NT4.0 or WIndows2000下测试速度时，测试的速度是平均的，即处理第一个500次数据和以后处理的每个500次数据的时间是相差不多的。而在win98下却明显感到处理第一个500次数据的时间较多。细查发现前20次处理速度较慢，以后正常。测试结果如下：
  --this 10 times!Time=0.330s
  --this 20 times!Time=0.220s
  --this 30 times!Time=0.060s
  --this 40 times!Time=0.000s
  --this 50 times!Time=0.050s
  --this 60 times!Time=0.060s
  --this 70 times!Time=0.050s
  --this 80 times!Time=0.000s
  --this 90 times!Time=0.060s
这可是我的设备和进程早已打开，而且已经处理过数据了。为什么？
另处，在不改变硬件的基础上，可采用什么方法再提高速度？
win98我用GetSystemTime好像只能计时作到50ms的级别，我用什么函数可精确至1ms甚至是100微秒级？