集成的网卡工作不工作

我在做一块MPC8245的主板，板上要集成几块pci总线的网卡，使用intel82559er芯片。我先用82559er做了一块pci卡的试验板，插在pc机上使用一切正常。但是集成到主板上，boot后网卡灯就是不亮，（以太网线由集线器连接，直连也不行）。不知道为什么，请做过的同仁指点一二。
由于操作系统需要由网卡传给rom（flash是贴上的，所以还不能加操作系统。


e2prom中已经进行了设置，用开发器可以读到82559的芯片信息。
我想很可能是boot的原因。现在用的boot是原来买的开发板带的（开发板上是pci总线接口，插82559网卡，说明中说也支持82559er），不知道从插卡到内嵌有什么需要注意的区别？
另外请问：有什么地方可以找到关于嵌入式系统boot方面的资料？谢谢!