怎么改善isa板卡驱动的效率？

我用的ISA总线数据采集卡为12位16路带硬件锁相环(PLL)的同步数据采集卡，采用4片AD公司的四通道12位同步数据采集芯片AD7874，全部四通道的采样频率为29kHz，占用两个中断号，用跳线设置为IRQ10和IRQ11，占用的I/O端口地址为0x280至0x29f。
驱动程序开发用的WinDriver5.04，已经可以使用了，但是就是效率存在很大的问题：仅仅打开板卡和启动采集就占去了60％的CPU！这还不包括读数（其实加上读数也差不多），所以怀疑是不是中断服务程序编制的问题。原来我在11号中断服务程序中加了数据的转换程序，后来把这个删去了，占用资源居然上去了，占到了95％以上！！！
我把WinDriver生成的代码封装成了一个dll，其主要部分包括：
①打开WinDriver设备(即ISA总线数据采集卡)
②对数据采集卡上芯片及中断初始化
③改写中断线程函数，加入端口操作
借助数据采集卡上的硬件电路，使数据采集卡在每两个工频周波所(由于硬件设计的原因，也可以设计为每个工频周波产生一次中断)产生一次IRQ10中断，两次中断的间隔由数据采集卡上的8254计数测得时间间隔，即可得到工频频率。要求对采集信号进行FFT分析，在每个周波内等间隔(锁相环实现)采样32点，产生32次IRQ11中断信号。改写了的两个中断线程功能为：IRQ10中断线程的功能为，清中断标志位，读8254计数器的值，清8254计数器，中断返回；IRQ11中断线程的功能为，将所有AD通道的采样值读入。
④关闭WinDriver设备
我想实现的是6路信号的采集，每一路的采样率为1600S/s，通过中断方式来采集应该不会占用太多CPU资源啊？我的机子是P3 667，392M，Win2K+sp1。
请各位大虾牛人出手相助，共同探讨，江湖救急啊～～～

觉得太奇怪了！昨晚通过做实验确定了是dll的问题，现在觉得这个推论也不见得正确。
理由是：
昨晚用最小系统的vi测试dll时，发觉即使vi不数取数据，也有60％，所以怀疑到dll的效率问题。同时，这个结论也受到vc程序的支持。因为vc的程序读数显示也占到了60％。
但是今天进一步实验的时候发觉，把中断服务程序里的数据转换部分去掉以后，同样的测试vi，竟然到95％了。然后做更极端的实验，把中断服务程序变成一个空程序，就是没有任何内容，vi调用占到了60％；但，用vc程序调用一个此类的dll时，几乎不占用CPU。