关于块加密和流加密的使用问题？

这个暑假，利用业余时间写了基于 Minifilter 框架下的透明加解密的一个程序，东西写好了，最初使用的加密算法是异或，测试都通过了，但是
想换成强度更高一些的 流加密或者块加密算法是出现了问题：

1：使用 RC_4 时，对 office 系列的软件会出现问题，但是对于文本正常；

2：使用 AES 时，对office 系列软件正常，但是对于文本的输入要是 16 的整数倍才能正常加解密（因为分组的原因）；

对于 1  种情况，看过以前的老贴，有人说是 “FSD 的随机读取正常的 ”，这个我不太明白，希望高手指教
对于 2 中情况，我跟踪了 IRP 的流程发现，除非能够将填充的内容也写回文件。不然，解密肯定出错。

对于块加密的方式，不知道各位大牛是怎么处理填充后的数据的，难道也是直接写回文件中 ？？？

自己顶一下。。。

对于填充的部分，我想应该是需要自己保存起来以便解密的时候使用的吧？
那么这部分是不是应该在文件的末尾追加若干个字节来保存它们呢，或者还有什么其他更好的办法？